既有研究表明，肠道微生物稳态在维持人体健康方面发挥重要作用，肠道微生物群组成和功能的改变与许多疾病有关。因此，从肠道菌群出发检测、干预、治疗和预防疾病成为重要的研究方向。肠菌移植被认为是一种“全肠道微生物组替代”的治疗策略，是恢复和重建肠道微生物稳态的重要创新治疗策略之一，成为世界范围内广受关注和积极研究的领域。
研究证实，肠菌移植对艰难梭菌感染、炎症性肠病、肠易激综合征、免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎、移植物抗宿主病、拮抗微生物多重耐药性等有良好的疗效，且并发症发生率低，有望成为肠菌移植治疗的新适应证。
我们从2014年开始开展肠菌移植临床研究。已发表的研究结果显示，一方面，肠菌移植可以改善HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者核苷类似物抗病毒耐药，并进一步阐述了HBV感染不同疾病阶段患者的肠道细菌和真菌的组学特征；另一方面，采用肠菌移植治疗难治性溃疡性结肠炎的队列研究发现，其总体有效率为76.2%，临床缓解率为57.1%，黏膜愈合率为47.6%，无严重不良反应发生，并且肠道微生物群落及代谢产物的改变是决定疗效的重要因素。
通过生物信息学挖掘及供体菌群的分离培养，我们获得多株有潜在治疗溃疡性结肠炎作用的“益生菌株”，并在模式动物上进行功能验证和机制研究。在此过程中，对肠菌移植技术的推广和应用，一方面促进了消化学科与微生物学、免疫学、肿瘤学、重症医学和营养学等多学科的发展和融合；另一方面，通过临床研究进一步规范了适应证、供体选择与管理、个体化治疗方案制定、肠菌移植伦理、标本库建设等技术环节；同时，对肠菌移植的衍生技术环节进行了创新，从而建立了一套系统化、标准化的肠道菌群移植体系，协同探索用肠菌移植治疗肠道外疾病的疗效及机制，将微生态研究贯穿于临床多学科建设。
（作者系厦门大学医学院微生态研究院院长）
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