6月10日记者获悉，华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位，成功组装了8个一年生鹰嘴豆属野生种基因组，并结合已发表的2个鹰嘴豆基因组，构建出鹰嘴豆属超级泛基因组，为鹰嘴豆育种提供了重要数据资源和研究方向。相关研究成果日前发表在《自然·遗传学》上。
鹰嘴豆是世界第三大豆类作物，被50多个国家种植和食用。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄，抵抗生物或非生物胁迫能力不足，限制了其育种改良。
研究构建的鹰嘴豆属超级泛基因组由24827个基因家族组成。其中，14748个基因家族为核心基因，它们存在于鹰嘴豆属所有物种中，主要参与生长、DNA修复、细胞通信等基本生物功能。6212个基因家族为可变基因，它们存在于鹰嘴豆属的2个至8个物种中，主要参与防御响应、生长素响应、生物刺激响应等生物功能。
此外，研究团队还鉴定出鹰嘴豆属内存在的2944万个单核苷酸多态性、633万个小插入缺失和491937个结构变异，并通过将鉴定出的结构变异整合到参考基因组中，挖掘出477个鹰嘴豆属个体中的变异多样性。结果发现，这些变异在开花时间和抗病性等重要性状中可能扮演重要角色。其中，678个结构变异与200个和开花相关的基因重叠，1667个结构变异与556个抗病基因重叠。
论文第一作者、国际半干旱热带作物研究中心高级科学家阿米尔·汗认为：“研究将野生近缘种这一非常重要的资源纳入，可在更广泛的基因多样性基础上挖掘农艺学性状相关重要基因，有望推动鹰嘴豆品种的遗传育种改良。”
6月10日记者获悉，华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位，成功组装了8个一年生鹰嘴豆属野生种基因组，并结合已发表的2个鹰嘴豆基因组，构建出鹰嘴豆属超级泛基因组，为鹰嘴豆育种提供了重要数据资源和研究方向。相关研究成果日前发表在《自然·遗传学》上。
鹰嘴豆是世界第三大豆类作物，被50多个国家种植和食用。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄，抵抗生物或非生物胁迫能力不足，限制了其育种改良。
研究构建的鹰嘴豆属超级泛基因组由24827个基因家族组成。其中，14748个基因家族为核心基因，它们存在于鹰嘴豆属所有物种中，主要参与生长、DNA修复、细胞通信等基本生物功能。6212个基因家族为可变基因，它们存在于鹰嘴豆属的2个至8个物种中，主要参与防御响应、生长素响应、生物刺激响应等生物功能。
此外，研究团队还鉴定出鹰嘴豆属内存在的2944万个单核苷酸多态性、633万个小插入缺失和491937个结构变异，并通过将鉴定出的结构变异整合到参考基因组中，挖掘出477个鹰嘴豆属个体中的变异多样性。结果发现，这些变异在开花时间和抗病性等重要性状中可能扮演重要角色。其中，678个结构变异与200个和开花相关的基因重叠，1667个结构变异与556个抗病基因重叠。
论文第一作者、国际半干旱热带作物研究中心高级科学家阿米尔·汗认为：“研究将野生近缘种这一非常重要的资源纳入，可在更广泛的基因多样性基础上挖掘农艺学性状相关重要基因，有望推动鹰嘴豆品种的遗传育种改良。”
本文链接：鹰嘴豆属超级泛基因组构建http://www.llsum.com/show-2-6813-0.html
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